Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms