Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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