Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms