Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms