Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms