Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms