Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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IFT27Q9BW83 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
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IFT27Q9BW83 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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IFT27Q9BW83 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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IFT27Q9BW83 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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IFT27Q9BW83 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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IFT27Q9BW83 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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