Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms