Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms