Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA4

MS4A14, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 14, humanhuman

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A14Q96JA4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A14Q96JA4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms