Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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