Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms