Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms