Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms