Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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USP53Q70EK8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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USP53Q70EK8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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USP53Q70EK8 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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USP53Q70EK8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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USP53Q70EK8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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USP53Q70EK8 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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USP53Q70EK8 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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