Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD2Q6Y1H2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms