Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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