Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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COL5A1-AS1Q5SY13 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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COL5A1-AS1Q5SY13 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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COL5A1-AS1Q5SY13 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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