Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms