Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CARTPTQ16568 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms