Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms