Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms