Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms