Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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