Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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FOXF1Q12946 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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FOXF1Q12946 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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FOXF1Q12946 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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FOXF1Q12946 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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FOXF1Q12946 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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FOXF1Q12946 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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FOXF1Q12946 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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