Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms