Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms