Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ID3Q02535 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ID3Q02535 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ID3Q02535 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ID3Q02535 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ID3Q02535 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ID3Q02535 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ID3Q02535 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms