Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA5Q01523 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms