Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms