Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms