Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA9P57773 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA9P57773 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA9P57773 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA9P57773 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA9P57773 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA9P57773 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA9P57773 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA9P57773 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA9P57773 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA9P57773 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA9P57773 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA9P57773 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA9P57773 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA9P57773 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA9P57773 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA9P57773 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA9P57773 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA9P57773 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA9P57773 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA9P57773 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA9P57773 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA9P57773 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA9P57773 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA9P57773 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA9P57773 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA9P57773 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA9P57773 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA9P57773 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA9P57773 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA9P57773 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA9P57773 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA9P57773 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA9P57773 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA9P57773 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA9P57773 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA9P57773 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA9P57773 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA9P57773 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA9P57773 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA9P57773 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA9P57773 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA9P57773 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA9P57773 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA9P57773 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA9P57773 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA9P57773 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA9P57773 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA9P57773 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA9P57773 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA9P57773 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA9P57773 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA9P57773 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA9P57773 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA9P57773 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA9P57773 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA9P57773 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA9P57773 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA9P57773 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA9P57773 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA9P57773 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA9P57773 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA9P57773 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA9P57773 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA9P57773 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA9P57773 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA9P57773 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA9P57773 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA9P57773 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA9P57773 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA9P57773 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA9P57773 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA9P57773 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA9P57773 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA9P57773 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA9P57773 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA9P57773 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA9P57773 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA9P57773 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA9P57773 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJA9P57773 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJA9P57773 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJA9P57773 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJA9P57773 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GJA9P57773 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJA9P57773 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJA9P57773 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJA9P57773 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJA9P57773 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJA9P57773 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJA9P57773 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJA9P57773 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA9P57773 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA9P57773 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA9P57773 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA9P57773 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA9P57773 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA9P57773 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA9P57773 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA9P57773 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms