Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms