Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms