Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ME1P48163 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ME1P48163 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ME1P48163 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ME1P48163 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ME1P48163 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ME1P48163 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ME1P48163 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ME1P48163 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ME1P48163 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ME1P48163 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ME1P48163 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ME1P48163 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ME1P48163 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ME1P48163 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ME1P48163 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ME1P48163 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ME1P48163 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ME1P48163 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ME1P48163 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ME1P48163 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ME1P48163 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ME1P48163 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ME1P48163 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ME1P48163 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ME1P48163 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ME1P48163 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ME1P48163 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ME1P48163 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ME1P48163 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ME1P48163 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ME1P48163 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ME1P48163 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ME1P48163 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ME1P48163 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ME1P48163 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ME1P48163 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ME1P48163 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ME1P48163 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ME1P48163 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ME1P48163 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ME1P48163 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ME1P48163 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ME1P48163 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ME1P48163 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ME1P48163 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ME1P48163 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ME1P48163 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ME1P48163 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ME1P48163 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ME1P48163 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ME1P48163 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ME1P48163 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ME1P48163 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ME1P48163 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ME1P48163 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ME1P48163 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ME1P48163 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ME1P48163 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ME1P48163 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ME1P48163 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ME1P48163 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms