Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRXP46100 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRXP46100 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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