Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms