Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF5P43026 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF5P43026 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF5P43026 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF5P43026 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF5P43026 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF5P43026 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF5P43026 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF5P43026 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF5P43026 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF5P43026 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF5P43026 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF5P43026 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF5P43026 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF5P43026 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF5P43026 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF5P43026 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF5P43026 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF5P43026 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF5P43026 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF5P43026 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF5P43026 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF5P43026 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF5P43026 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF5P43026 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF5P43026 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF5P43026 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF5P43026 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF5P43026 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF5P43026 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF5P43026 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF5P43026 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF5P43026 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF5P43026 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF5P43026 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF5P43026 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF5P43026 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF5P43026 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF5P43026 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF5P43026 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF5P43026 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF5P43026 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF5P43026 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF5P43026 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF5P43026 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF5P43026 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF5P43026 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF5P43026 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF5P43026 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF5P43026 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF5P43026 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF5P43026 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF5P43026 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF5P43026 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF5P43026 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF5P43026 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF5P43026 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF5P43026 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF5P43026 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF5P43026 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF5P43026 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF5P43026 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF5P43026 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF5P43026 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF5P43026 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF5P43026 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF5P43026 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF5P43026 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF5P43026 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF5P43026 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF5P43026 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF5P43026 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF5P43026 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF5P43026 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF5P43026 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF5P43026 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF5P43026 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF5P43026 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF5P43026 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms