Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP6P35125 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP6P35125 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP6P35125 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP6P35125 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP6P35125 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP6P35125 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP6P35125 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP6P35125 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP6P35125 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP6P35125 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP6P35125 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP6P35125 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP6P35125 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP6P35125 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP6P35125 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP6P35125 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP6P35125 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
USP6P35125 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
USP6P35125 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP6P35125 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP6P35125 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP6P35125 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP6P35125 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP6P35125 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP6P35125 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP6P35125 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
USP6P35125 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP6P35125 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP6P35125 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP6P35125 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP6P35125 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP6P35125 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP6P35125 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP6P35125 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP6P35125 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP6P35125 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP6P35125 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP6P35125 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP6P35125 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP6P35125 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP6P35125 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP6P35125 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP6P35125 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP6P35125 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP6P35125 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
USP6P35125 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
USP6P35125 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP6P35125 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
USP6P35125 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP6P35125 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP6P35125 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP6P35125 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP6P35125 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP6P35125 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP6P35125 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP6P35125 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP6P35125 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP6P35125 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP6P35125 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP6P35125 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP6P35125 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP6P35125 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP6P35125 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP6P35125 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP6P35125 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP6P35125 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP6P35125 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP6P35125 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP6P35125 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP6P35125 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP6P35125 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP6P35125 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP6P35125 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6P35125 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6P35125 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6P35125 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6P35125 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6P35125 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6P35125 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6P35125 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6P35125 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6P35125 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6P35125 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6P35125 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6P35125 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6P35125 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6P35125 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6P35125 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6P35125 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6P35125 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6P35125 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6P35125 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6P35125 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6P35125 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6P35125 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6P35125 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP6P35125 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP6P35125 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP6P35125 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms