Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL9P32969 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL9P32969 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL9P32969 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL9P32969 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL9P32969 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL9P32969 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL9P32969 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL9P32969 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL9P32969 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL9P32969 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL9P32969 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL9P32969 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL9P32969 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL9P32969 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL9P32969 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL9P32969 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL9P32969 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL9P32969 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL9P32969 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL9P32969 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL9P32969 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL9P32969 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL9P32969 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms