Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TSPOP30536 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TSPOP30536 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TSPOP30536 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TSPOP30536 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TSPOP30536 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TSPOP30536 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TSPOP30536 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TSPOP30536 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TSPOP30536 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TSPOP30536 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TSPOP30536 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TSPOP30536 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TSPOP30536 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TSPOP30536 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TSPOP30536 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TSPOP30536 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TSPOP30536 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TSPOP30536 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TSPOP30536 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TSPOP30536 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TSPOP30536 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TSPOP30536 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TSPOP30536 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TSPOP30536 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TSPOP30536 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TSPOP30536 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TSPOP30536 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TSPOP30536 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TSPOP30536 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TSPOP30536 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TSPOP30536 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TSPOP30536 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TSPOP30536 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TSPOP30536 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TSPOP30536 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TSPOP30536 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TSPOP30536 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TSPOP30536 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TSPOP30536 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TSPOP30536 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TSPOP30536 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TSPOP30536 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TSPOP30536 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TSPOP30536 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TSPOP30536 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TSPOP30536 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TSPOP30536 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms