Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms