Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms