Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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