Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms