Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms