Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CUX2O14529 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CUX2O14529 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CUX2O14529 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CUX2O14529 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CUX2O14529 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CUX2O14529 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CUX2O14529 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CUX2O14529 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CUX2O14529 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CUX2O14529 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CUX2O14529 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CUX2O14529 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CUX2O14529 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CUX2O14529 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CUX2O14529 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CUX2O14529 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CUX2O14529 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CUX2O14529 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CUX2O14529 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CUX2O14529 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CUX2O14529 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CUX2O14529 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CUX2O14529 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CUX2O14529 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CUX2O14529 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CUX2O14529 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CUX2O14529 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CUX2O14529 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CUX2O14529 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CUX2O14529 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CUX2O14529 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CUX2O14529 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CUX2O14529 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CUX2O14529 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CUX2O14529 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CUX2O14529 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CUX2O14529 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CUX2O14529 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CUX2O14529 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CUX2O14529 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUX2O14529 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUX2O14529 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUX2O14529 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUX2O14529 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUX2O14529 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUX2O14529 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUX2O14529 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUX2O14529 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUX2O14529 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUX2O14529 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUX2O14529 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUX2O14529 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUX2O14529 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUX2O14529 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUX2O14529 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CUX2O14529 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUX2O14529 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUX2O14529 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUX2O14529 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUX2O14529 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUX2O14529 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUX2O14529 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUX2O14529 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUX2O14529 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUX2O14529 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUX2O14529 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUX2O14529 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUX2O14529 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUX2O14529 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CUX2O14529 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUX2O14529 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CUX2O14529 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUX2O14529 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUX2O14529 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CUX2O14529 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUX2O14529 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUX2O14529 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUX2O14529 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUX2O14529 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUX2O14529 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUX2O14529 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUX2O14529 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUX2O14529 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUX2O14529 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CUX2O14529 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CUX2O14529 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CUX2O14529 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CUX2O14529 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CUX2O14529 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CUX2O14529 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CUX2O14529 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CUX2O14529 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CUX2O14529 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CUX2O14529 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CUX2O14529 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CUX2O14529 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CUX2O14529 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CUX2O14529 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CUX2O14529 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms