Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms