Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

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Length 135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LINC01387J3KSC0 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LINC01387J3KSC0 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LINC01387J3KSC0 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LINC01387J3KSC0 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LINC01387J3KSC0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LINC01387J3KSC0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LINC01387J3KSC0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LINC01387J3KSC0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LINC01387J3KSC0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LINC01387J3KSC0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LINC01387J3KSC0 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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LINC01387J3KSC0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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LINC01387J3KSC0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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LINC01387J3KSC0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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LINC01387J3KSC0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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LINC01387J3KSC0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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LINC01387J3KSC0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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