Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR11A4FU01 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms